开发基于纳米孔RNA直接测序的可迁移深度学习框架鉴定多种类型的RNA化学修饰

近日，上海交通大学生命科学技术学院聘教轨副教授余祥长课题组和上海辰山植物园杨俊/王红霞团队合作在《Nature Communications》发表题为“Transfer learning enables identification of multiple types of RNA modifications using nanopore direct RNA sequencing”的研究论文。作者结合纳米孔RNA直接测序技术和深度学习方法开发了可同时检测多种类型RNA修饰的迁移学习模型TandemMod（图1）。上海交通大学生命科学技术学院博士后吴优为论文第一作者，生命科学技术学院余祥长聘教轨副教授、辰山植物园研究员王红霞和杨俊为该论文通讯作者。

图1. 基于纳米孔RNA直接测序数据搭建TandemMod深度学习框架的示意图